Comparative bioinformatics analysis and abiotic stress responses of expansin proteins in Cucurbitaceae members: watermelon and melon
Yazarlar (10)
Çınar Yiğit İncili
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Dr. Öğr. Üyesi Büşra Arslan Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Esra Nurten Yer Çelik Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Dr. Öğr. Üyesi Ferhat ULU Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Erdoğan Horuz
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Prof. Dr. Mehmet Cengiz BALOĞLU Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Ebrar Çağlıyan
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Gamze Burcu
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Dr. Öğr. Üyesi Aslı Ugurlu Bayarslan Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Prof. Dr. Yasemin ÇELİK ALTUNOĞLU Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
| Makale Türü | Özgün Makale (SSCI, AHCI, SCI, SCI-Exp dergilerinde yayınlanan tam makale) | ||
| Dergi Adı | Protoplasma (Q2) | ||
| Dergi ISSN | 0033-183X Wos Dergi Scopus Dergi | ||
| Dergi Tarandığı Indeksler | SCI | ||
| Makale Dili | Türkçe | Basım Tarihi | 03-2023 |
| Kabul Tarihi | 02-07-2022 | Yayınlanma Tarihi | 09-07-2022 |
| Cilt / Sayı / Sayfa | 260 / 2 / 509–527 | DOI | 10.1007/s00709-022-01793-8 |
| Makale Linki | http://dx.doi.org/10.1007/s00709-022-01793-8 | ||
| UAK Araştırma Alanları |
Biyoteknoloji
Moleküler Biyoloji
|
||
| Özet |
| Watermelon and melon are members of the Cucurbitaceae family including economically significant crops in the world. The expansin protein family, which is one of the members of the cell wall, breaks down the non-covalent bonds between cell wall polysaccharides, causing pressure-dependent cell expansion. Comparative bioinformatics and molecular characterization analysis of the expansin protein family were carried out in the watermelon (Citrullus lanatus) and melon (Cucumis melo) plants in the study. Gene expression levels of expansin family members were analyzed in leaf and root tissues of watermelon and melon under ABA, drought, heat, cold, and salt stress conditions by quantitative real-time PCR analysis. After comprehensive searches, 40 expansin proteins (22 ClaEXPA, 14 ClaEXPLA, and 4 ClaEXPB) in watermelon and 43 expansin proteins (19 CmEXPA, 15 CmEXPLA, 3 CmEXPB, and 6 … |
| Anahtar Kelimeler |
| Abiotic stresses | Characterization | Citrullus lanatus | Cucumis melo | Expansin genes |
| Atıf Sayıları | |
| Scopus | 12 |
| Google Scholar | 17 |