img
Molecular Cloning Characterization and Expression Analysis of a Gene Encoding a Ran Binding Protein RanBP in Cucumis melo L        
Yazarlar
Prof. Dr. Mehmet Cengiz BALOĞLU Prof. Dr. Mehmet Cengiz BALOĞLU
Kastamonu Üniversitesi
Florence Negre Zakharov
Huseyin Avni Oktem
Aye Meral Yucel
Özet
GTP-bağlayıcı protein ailesinin yüksek derecede korunmuş üyesi olan Ran bağlayıcı proteinleri (RanBPs) stoplazma ve çekirdek arasındaki çekirdek proteinlerin ihracatına katılmaktadırlar. Bu çalışmada, kavundan (Cucumis melo L.) RACE metodu kullanılarak CmRanBP geni izole edilmiştir. 778 baz çift i uzunluğunda ve 197 amino asiti (22,2 kDa protein) kodlayan kavun RanBP cDNA’sı karakterize edilmiştir (GenBank erişim no: EU853459). CmRanBP genine ait tahmini aminoasit sekansının Vitis vinifera, Populus trichocarpa ve Ricinus communis bitkilerine ait sırasıyla VvRanBP, PtRanBP, and RcRanBP genleri ile % 70 oranında benzerlik gösterdiği bulunmuştur. Çeşitli bitki türlerinde RanBD (Ran bağlayıcı domain) içinde RanBP gen ailesinin bütün üyelerinde yüksek oranda korunumlu beş motif ve bir tane Ran bağlayıcı motif bulunmuştur. Yüksek sıcaklık stresi altında farklı dokularda CmRanBP gen ifade profi lleri de yarı kantitatif RT-PCR ile incelendi. Kontrol ortamı olarak 25 °C’de CmRanBP geni kök, yaprak ve gövdelerde benzer bir şekilde ifade edilmiştir. Ancak, sıcaklık 38 °C ve 40 °C’ ye yükseltildiği zaman, kök, yaprak ve gövde dokularında CmRanBP gen ifade düzeyi anlamlı (P < 0,05) şekilde artmıştır. Biz burada ilk kez CmRanBP gen ifadesinin ısı stres yanıtları ile ilişkili olduğunu göstermekteyiz.
Anahtar Kelimeler
Gene cloning | Gene expression | Heat stress | Melon (cucumis melo L.) | Ran binding protein (RanBP)
Makale Türü Özgün Makale
Makale Alt Türü SSCI, AHCI, SCI, SCI-Exp dergilerinde yayımlanan tam makale
Dergi Adı TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
Dergi ISSN 1300-0152
Dergi Tarandığı Indeksler SCI-Expanded
Makale Dili İngilizce
Basım Tarihi 01-2011
Cilt No 35
Sayı 4
Sayfalar 387 / 397
Doi Numarası 10.3906/biy-1004-94
Makale Linki http://journals.tubitak.gov.tr/biology/issues/biy-11-35-4/biy-35-4-1-1004-94.pdf