| Salmonella cinsinin üyesi olan bakterilerin koloni yapıları genellikle düzgün (smooth, S) özellik göstermektedir. Bu nedenle literatürde mukoid görünümde koloni oluşturan Salmonella suşlarına çok nadiren rastlanmaktadır. Mukoid yapıya sahip olan suşların tür düzeyinde tanımlanması konvansiyonel yöntemlerle zor olmaktadır; zira mukus tabakası bakterinin antijenik reaksiyonlara tepki vermesini engellemektedir. Bu çalışmanın amacı, kaba (rough, R) veya mukoid (M) formda Salmonella izolatları ile karşılaşılan durumlarda polimeraz zincir reaksiyonu ile serotiplendirmenin hızlı ve güvenilir bir yöntem olduğunu vurgulamaktır. Hastanemizde nefrolitiazis tanısı ile takip edilen 17 yaşındaki bir kadın hastanın idrar kültüründe 100.000 cfu/ml mukoid koloni oluşturan gram-negatif basil üremiştir. İzolat, biyokimyasal testler ve Vitek 2 (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile Salmonella sp. olarak tanımlanmış, bilinen antiserumlarla yapılan aglütinasyon testlerinde negatif sonuç alınmıştır. İzolatın mukoid olmasından dolayı aglütinasyonun oluşamadığı düşünülmüştür. Tanı, Vitek MS MALDI-TOF (bioMérieux, Fransa) analiz yöntemi ile de Salmonella sp. olarak doğrulanmış, ancak yine tür düzeyinde tanımlama yapılamamıştır. Mukoid koloninin Salmonella sp. olduğu, invA primerleri ile yapılan cinse özgül PCR yönteminde yaklaşık 284 baz çifti (bç) büyüklüğünde PCR amplikonunun oluşması sonucu doğrulanmıştır. Ardından, O:B (O:4), O:C1 (O:7), O:C2-C3 (O:8), O:D (O:9, O:9,46, O:9,46,27), O:E (O:3,10, O:3,19) somatik antijenlerinin tespit edilebildiği bir multipleks PCR (mPCR) ile serogruplandırma yapılmıştır. Mukoid Salmonella türünün yaklaşık 615 bç büyüklüğünde bant oluşturduğu ve D grubu içinde yer aldığı tespit edilmiştir. Bu suşun, insanlardan sıklıkla izole edilen D1 grubunda yer alıp almadığını tespit etmek için, O:D1(O:9) ve O:E1(3,10) somatik antijenlerinin belirlenebildiği bir diğer mPCR uygulanmış ve yaklaşık 624 bç büyüklüğünde oluşturduğu bant ile izolatın D1 grubunda yer aldığı belirlenmiştir. D1 grubunda yer alan mukoid Salmonella türünün faz-1 flajellar antijenlerinin belirlenmesi için uygulanan mPCR sonucu, izolat Salmonella Enteritidis (1,9,12:g,m:-) olarak tiplendirilmiştir. Disk difüzyon yöntemi ile CLSI’nın önerilerine uygun olarak yapılan antibiyotik duyarlılık testinde izolatın ampisilin, siprofloksasin, seftriakson, trimetop- rim-sülfametoksazol ve kloramfenikole duyarlı olduğu bulunmuştur. Sonuç olarak, somatik, flajellar antijenlerin eksprese edilmediği, kaba veya mukoid formda Salmonella izolatları ile karşılaşılan durumlarda, PCR yönteminin hızlı ve güvenilir bir alternatif yöntem olarak, konvansiyonel serotiplendirmeye yardımcı olabileceği ortaya konmuştur. |
Fulya Bayındır Bilman
Doç. Dr. Elçin GÜNAYDIN
