img
img
Molecular Prevalence and Phylogenetic Characterization of Enterocytozoon bieneusi in Healthy Cattle       
Yazarlar (6)
Tuğba Bilgin
Sadullah Usluğ
Gupse Kübra Karademir
Dr. Öğr. Üyesi Mübeccel ATELGE Dr. Öğr. Üyesi Mübeccel ATELGE
Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Gamze Yetişmiş
Erciyes Üniversitesi, Türkiye
Alparslan Yıldırım
Erciyes Üniversitesi, Türkiye
Devamını Göster
Özet
Amaç: Bu çalışmada sağlıklı sığırlarda Enterocytozoon bieneusi’nin moleküler prevalansının ve genotiplerinin belirlenmesiamaçlanmıştır.Yöntemler: Çalışmada, Ekim 2017 ve Mart 2018 tarihleri arasında Sivas yöresindeki sağlıklı görünümlü 150 sığırdan dışkıörnekleri toplanmış ve genomik DNA (gDNA) izolasyonları yapılmıştır. Elde edilen gDNA izolatları, E. bieneusi’nin identifikasyonuamacıyla, ITS rRNA gen bölgesini amplifiye eden Nested PZR ile işlenmiştir. E. bieneusi pozitif izolatların ITS rRNA gen bölgesiamplikonları genotiplendirme ve filogenetik analizler için sekanslanmıştır. Elde edilen sekanslar uygun genetik yazılımlarlaişlenerek genotipik yapıları ve sonrasında da filogenetik ilişkileri ortaya çıkarılmıştır.Bulgular: Nested PZR ile incelemesi yapılan örneklerden 29’u (%19,3) E. bieneusi yönünden pozitif bulunmuştur. Sekansanalizleri sonucu beş ayrı genotip belirlenmiştir. En yaygın genotip olarak bulunan ERUSS1 genotipi ile ERUSS2-4 genotipleriyakın genotipler olarak karakterize edilmiş ve ilk kez rapor edilmiştir. İki izolatın ise Almanya’da bir sığırdan rapor edilmiş olan Ngenotipinde olduğu belirlenmiş ve diğer genotiplerden daha farklı olduğu görülmüştür. Filogenetik analizler çalışmada karakterizeedilen tüm genotiplerin genogrup 2’de yer aldığını ortaya koymuştur.Sonuç: Bu çalışma ile Türkiye’de sığırlarda E. bieneusi enfeksiyonları üzerine ilk moleküler epidemiyolojik veriler elde edilmiştir.
Anahtar Kelimeler
Enterocytozoon bieneusi | healthy cattle | molecular prevalence | phylogenetic characterization | Turkey
Makale Türü Özgün Makale
Makale Alt Türü SCOPUS dergilerinde yayımlanan tam makale
Dergi Adı Turkish Journal of Parasitology
Dergi ISSN 1300-6320 Scopus Dergi
Dergi Tarandığı Indeksler Scopus
Makale Dili Türkçe
Basım Tarihi 01-2020
Cilt No 44
Sayı 1
Sayfalar 36 / 42
Doi Numarası 10.4274/tpd.galenos.2020.6851
Makale Linki http://dx.doi.org/10.4274/tpd.galenos.2020.6851