Molecular Prevalence and Phylogenetic Characterization of Enterocytozoon bieneusi in Healthy Cattle
Yazarlar (6)
Tuğba Bilgin Erciyes Üniversitesi, Türkiye
Sadullah Usluğ Erciyes Üniversitesi, Türkiye
Gupse Kübra Karademir Erciyes Üniversitesi, Türkiye
Dr. Öğr. Üyesi Mübeccel ATELGE Kastamonu Üniversitesi, Türkiye
Gamze Yetişmiş Erciyes Üniversitesi, Türkiye
Alparslan Yıldırım Erciyes Üniversitesi, Türkiye
| Makale Türü |
Özgün Makale
(SCOPUS dergilerinde yayınlanan tam makale)
|
||
| Dergi Adı | Turkiye Parazitoloji Dergisi | ||
| Dergi ISSN | 1300-6320 Scopus Dergi | ||
| Dergi Tarandığı Indeksler | Scopus | ||
| Makale Dili | Türkçe | Basım Tarihi | 01-2020 |
| Cilt / Sayı / Sayfa | 44 / 1 / 36–42 | DOI | 10.4274/tpd.galenos.2020.6851 |
| Makale Linki | http://dx.doi.org/10.4274/tpd.galenos.2020.6851 | ||
| Özet |
| Amaç: Bu çalışmada sağlıklı sığırlarda Enterocytozoon bieneusi’nin moleküler prevalansının ve genotiplerinin belirlenmesiamaçlanmıştır.Yöntemler: Çalışmada, Ekim 2017 ve Mart 2018 tarihleri arasında Sivas yöresindeki sağlıklı görünümlü 150 sığırdan dışkıörnekleri toplanmış ve genomik DNA (gDNA) izolasyonları yapılmıştır. Elde edilen gDNA izolatları, E. bieneusi’nin identifikasyonuamacıyla, ITS rRNA gen bölgesini amplifiye eden Nested PZR ile işlenmiştir. E. bieneusi pozitif izolatların ITS rRNA gen bölgesiamplikonları genotiplendirme ve filogenetik analizler için sekanslanmıştır. Elde edilen sekanslar uygun genetik yazılımlarlaişlenerek genotipik yapıları ve sonrasında da filogenetik ilişkileri ortaya çıkarılmıştır.Bulgular: Nested PZR ile incelemesi yapılan örneklerden 29’u (%19,3) E. bieneusi yönünden pozitif bulunmuştur. Sekansanalizleri sonucu beş ayrı genotip belirlenmiştir. En yaygın genotip olarak bulunan ERUSS1 genotipi ile ERUSS2-4 genotipleriyakın genotipler olarak karakterize edilmiş ve ilk kez rapor edilmiştir. İki izolatın ise Almanya’da bir sığırdan rapor edilmiş olan Ngenotipinde olduğu belirlenmiş ve diğer genotiplerden daha farklı olduğu görülmüştür. Filogenetik analizler çalışmada karakterizeedilen tüm genotiplerin genogrup 2’de yer aldığını ortaya koymuştur.Sonuç: Bu çalışma ile Türkiye’de sığırlarda E. bieneusi enfeksiyonları üzerine ilk moleküler epidemiyolojik veriler elde edilmiştir. |
| Anahtar Kelimeler |
| Enterocytozoon bieneusi | healthy cattle | molecular prevalence | phylogenetic characterization | Turkey |
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
| Atıf Sayıları | |
| Scopus | 24 |
| Google Scholar | 28 |